1.辦公室：負責醫院日常行政、黨務、人事管理工作和醫院宣傳，對外協調、接待工作，車輛管理工作，處理群眾來信來訪事務；負責行政、黨務會議準備及記錄，草擬行政、黨務、人事文件，公文印制、收發管理工作，收集整理行政、黨務、人事文件歸檔和人事檔案管理。
    2.醫教科：負責醫療業務、醫療教學及科研日常工作，承辦醫療業務證件申辦、年審及衛生專業技術人員的職稱考試考核、證件辦理事務和病歷規范管理，起草醫療業務、教學、科研文件資料并整理歸檔。
    3.護理部：負責護理業務管理及護理人員繼續教育、日常管理工作，起草護理業務的文件、資料并整理歸檔。
    4.財務科：負責財會業務工作及養老保險、失業保險、工傷保險、住房公積金日常工作和固定資產管理，職工工資福利待遇核算與發放、醫療業務外欠款催收管理工作，財會檔案整理與管理。
    5.精神衛生防治管理辦公室（簡稱：精防辦）：履行“達州市精神衛生中心”機構相關職能，負責全市重性精神疾病社會防治管理和精神衛生公共服務日常指導工作，擬定相關文件、資料并歸檔。
    6.感染管理科：負責全院感染控制工作和傳染病管理及處置院內重大感染事件，承辦醫院一次性醫療器材日常管理事務和醫療器材消毒工作。
    7.總務設備科：負責后勤保障、辦公用品及設備儀器采購與管理，公房和水電氣的維修與管理，院內環境管理和醫院安全保衛、消防、衛生日常工作及其文件、資料的起草與歸檔管理。
    8.信息和醫療保險科：負責全院信息、統計工作、網絡管理和城鎮職工、城鎮居民、新農合的日常工作與報賬，做好與新農合、醫保費用的對賬、收取工作，并及時與財務科對賬；承辦醫保、信息文件、資料起草與整理歸檔；負責文書、病歷檔案室、圖書室日常管理。